Die Bayerische Oberlandbahn GmbH zählt zur Spitzengruppe der von Stiftung Warentest getesteten Regionalbahnen. In der Juli-Ausgabe 2003 der Zeitschrift "Test" vergleicht ein ausführlicher Bericht verschiedene Bahnen in Deutschland.
Fazit der Stiftung Warentest: Die BOB ist "eine der besten Bahnen im Test". Für den Service und Komfort im Zug gab es die Gesamtnote "Gut", ebenso für die Sauberkeit der Züge und die Fahrgast-information. Ein "Sehr gut" erhielt sogar der Servicetest Fundsache. Doch das bedeutet natürlich nicht, dass es nichts mehr zu verbessern gibt. Beispielsweise wurde die Fahrgastinformation im Zug nur mit einem "Befriedigend" bewertet, ebenso die Fahrgastbetreuung mit Imbissangebot.
"Im Großen und Ganzen sind wir natürlich stolz über die gute Bewertung der BOB.", so Heino Seeger, technischer Geschäftsführer der BOB. "Wer hätte noch vor drei Jahren gedacht, dass wir heute laut Stiftung Warentest zu Deutschlands besten Eisenbahnen zählen. Ein großer Dank gebührt vor allem unseren hochmotivierten Mitarbeitern und deren Einsatz. Selbstverständlich werden wir auch in Zukunft weiter an einem leistungsstarken Schienenpersonennahverkehr arbeiten. Wesentlich hierfür ist vor allem der Bau weiterer Integrale."